Triptofan, bağırsak sağlığını duygusal denge ile ilişkilendirir. Dengesizlikler sindirimi bozar ve kaygı veya düşük ruh hali tetikler. Basit gıdalar dengeyi yeniden sağlamaya yardımcı olabilir.

Kronik ishal, karın ağrısı, anksiyete, sinirlilik ve depresyon genellikle bağırsak bakterilerini ve serotonin düzeyini bozarak triptofan dengesizliğine geri bağlanır. Diyetler ve takviyelere rağmen, belirtiler devam eder çünkü bağırsak florası ve metabolizmadaki kök neden ele alınmamıştır. Bu sorunları tetikleyen bağırsak-beyin bağlantısını anlamak önemlidir.